2018-11-07 09:19:44 +0000 2018-11-07 09:19:44 +0000
1
1
Advertisement

Waarom wordt medicijnmodelbouw gedistribueerd op de computers van gewone mensen?

Advertisement

Er zijn enkele gedistribueerde computerprojecten op het internet die een remedie voor ziekten proberen te vinden, zoals World Community Grid . Kan iemand zeggen waarom er zulke dingen zijn en hoe nuttig die zijn? Ik bedoel, ik geloof dat als je een serieuze onderzoeker bent, ik denk dat je in staat bent om universitaire netwerken of supercomputers te gebruiken om te modelleren. Dus wat is het idee om het modelleren te verspreiden naar gewone computers? Vereist het medicijn modelleren zoveel computerkracht dat computers op universiteiten niet genoeg computerkracht hebben?

Advertisement
Advertisement

Antwoorden (1)

3
3
3
2018-11-07 11:22:05 +0000

Ik weet niet hoe gemakkelijk de beschikbare supercomputers beschikbaar zijn voor onderzoekers en universiteiten, maar ik kan me voorstellen dat het antwoord op uw vraag voor een groot deel te wijten is aan de kosten.

Supercomputers vs Distributed Computing Projects

Computerprestaties worden gemeten in FLOPS (Floating Point Operations Per Second) , en in juni 2018,&nbsp Summit , een door IBM gebouwde supercomputer die nu draait bij het Department of Energy’s (DOE) Oak Ridge National Laboratory (ORNL), legde de nummer één plek vast voor de snelste computerprestaties op  122. 3 petaFLOPS op de LINPACK-benchmark waar peta 1015 is. In vergelijking met de thuispc’s levert de snelst mogelijke processor voor thuispc’s tegen een kostprijs van 2000 dollar ca. 1 teraFLOPS waar tera 1012 is.

Laten we voor gedistribueerde computerprojecten eens kijken naar Folding@home .

Het project maakt gebruik van de idle processing resources van duizenden personal computers die eigendom zijn van vrijwilligers die de software op hun systemen hebben geïnstalleerd. Het belangrijkste doel is om de mechanismen van eiwitvouwing te bepalen, wat het proces is waarbij eiwitten hun uiteindelijke driedimensionale structuur bereiken, en om de oorzaken van eiwitmisvouwing te onderzoeken. Dit is van groot academisch belang met grote implicaties voor medisch onderzoek naar de ziekte van Alzheimer, de ziekte van Huntington, en vele vormen van kanker, onder andere. In mindere mate probeert Folding@home ook om predict a proteïne’s uiteindelijke structuur en bepalen hoe andere moleculen kunnen interageren met het, dat toepassingen heeft in drug design. Folding@home wordt ontwikkeld en beheerd door het Pande Laboratorium at Stanford University

[…]

Sinds de lancering op oktober 1, 2000, heeft het Pande Lab 200 wetenschappelijk onderzoekspapers geproduceerd als direct resultaat van Folding@home [zie https://foldingathome. org/papers-resultaten

Statistieken verstrekt door Folding@home op https://stats.foldingathome.org/os geven aan dat hun project in totaal 47.344 inheemse teraFLOPS of 98.747 x86 teraFLOPS oplevert.

Merk op dat deze teraFLOPS-waarden afkomstig zijn van de softwarekernen, niet van de piekwaarden van de CPU/GPU-specificaties en dat deze cijfers de prestaties van China’s Sunway TaihuLight in 2016, dat met 93 petaFLOPS op de LINPACK-benchmark nu de op één na snelste supercomputer ] als snelste ter wereld werd gerangschikt, net overtreffen.

Cost

IBMs Summit Supercomputer kostte 200 miljoen dollar om te bouwen en volgens Wikipedia kostte de Sunway TaihuLight 273 miljoen dollar. Als je bedenkt dat de computerprestaties van Folding@home worden geleverd door vrijwilligers (dus het systeem is gratis), dan is het een no brainer dat de aangeboden rekenkracht niet mag worden afgewend.

Advertisement

Gerelateerde vragen

3
2
1
2
2
Advertisement